Shotgun Metagenomik Dizileme ve Analiz
Oxford Nanopore Teknolojisi ile Dizileme
Kütüphane Hazırlığı
Yazılım
Biyoinformatik hizmeti ya da
Oxford Nanopore Teknolojilerinin sağladığı biyoinformatik yazılımları
Örnek Türleri
- İnsan
- Hayvan
- Çevre
- Gıda
- Endüstri
Gerçek Zamanlı Dizileme ve Analiz
MinION Mk1C GridION X5
Dizileme Kimyası ve Özellikleri
Metagenomik Analizler
Massive Bioinformatics Oxford Nanopore teknolojisi ile üretilen uzun amplikonlar ile analizler sunmaktadır. Korunmuş bölgelere sahip olmayan virüs gibi organizmalara yönelik yapılacak metagenomik analizlerde shotgun dizileme yöntemleri öne çıkmaktadır. Ayrıca, yeni enzimlerin keşfi, antimikrobiyal direnç genlerinin saptanması, ortamda bulunan mikroorganizmaların tüm genomunun oluşturulması, zamana bağlı değişim analizleri gibi bir çok farklı amaca bu analizler ile ulaşmanız mümkündür.
OXFORD NANOPORE TEKNOLOJİLERİ İLE HİZMET ALIM KOŞULLARI
– Uzun okuma ile tüm genom dizilemelerinde insersiyon ve delesyonları analiz edebilirsiniz.
– Organizmaların tür tayininde kesin sonuca kayıtsız bir şekilde ulaşabilirsiniz.
- Hizmet Alımı Öncesi
- Hizmet Alımı Sonrası
- Önerilen DNA ekstraksiyon kit ya da metodu nedir?
- Saf kültür mü? Karışık kültür mü?
- Hangi organizma tipi?
- Tüm genom uzunluğu nedir?
- Jel görüntüsü nasıl?
- Yürütme bilgisi ve data (.Fast5 ya da .FastQ)
- Biyoinformatik analizler*
- De novo dizileme
- Referans genom hizalama
- Karşılaştırmalı genom analizleri
İleri analizler
* Biyoinformatik analiz hizmeti detayı için lütfen irtibata geçiniz
