Nucleus Genetics olarak genetik materyalde gizli olan şifreyi çözüp tanı, tedavi, gıda/su güvenliği vs. gibi konularda yeni ve güvenilir bir perspektif sunmayı ve toplumumuzda genetik gelişmelerle ilgili farkındalık yaratmayı amaçlamaktayız

Viral Metagenomik Dizileme ve Analiz

Shotgun metagenomik analizi ile bir örnek içerisinde bulunan tüm nükleik asit bilgisine ulaşmak mümkündür. Bu yöntem ile elde edilen toplam genomik materyalin tamamı dizilenir ve sonrasında hedef organizma gruplarına veya genlere yönelik veritabanları ile istenilen bilgilere ulaşılır. Korunmuş bölgelere sahip olmayan virüs gibi organizmalara yönelik yapılacak metagenomik analizlerde shotgun dizileme yöntemleri öne çıkmaktadır.

  • Uzun okuma ile daha doğru sonuçlar
  • Ortamda bulunan tüm genler
  • Metagenomik verilerden tüm genom oluşturma
  • Viral metagenomik
  • Oxford Nanopore Teknolojisi İle Dizileme
    Kütüphane Hazırlığı

    Kütüphane Hazırlığı Kitleri ya da VolTRAX v2

    Yazılımlar
    • Biyoinformatik hizmeti ya da Oxford Nanopore Teknolojilerinin sağladığı biyoinformatik yazılımları
    Örnek türleri
    • İnsan
    • Hayvan
    • Çevre
    • Gıda
    • Endüstri
    Gerçek Zamanlı Dizileme ve Analiz
    • MinION
      MinION Mk1C
      Kütüphane GridION X5

    Dizileme Kimyası ve Özellikleri

    Dizileme Kimyası ve Özellikleri
    Hazırlama süresi
    80 dk
    Gerekli DNA miktarı
    1000 ng gDNA
    Çoklu çalışma
    1-3 örnek
    Okuma uzunluğu
    Tüm fragman boyları
    Sekanslama süresi*
    0-48 saat *İstenilen veri miktarına göre değişmektedir.

    VİRAL METAGENOMİK

    Shotgun Metagenomik analizler

    Shotgun metagenomik analizler çok farklı örnek tipini, veya bir örneğin bileşenlerini
    detaylı incelemek için oldukça fazla sayıda olanak sağlamaktadır. Aşağıda viral
    metagenomik için hizmet sağladığımız analiz çeşitleri yer almaktadır.

    DNA kalitesine bağlı olarak,
    200 kb’a kadar uzun okumalar
    yapmak mümkün. Çok fazla
    genetik materyalin olduğu
    karışık örneklerde yüksek
    doğruluk ve güvenilir sonuçlar
    için daha uzun okumalar
    oldukça önem arz etmektedir.

    Metagenomik analizler
    sonucunda yeterince temsil
    edilen organizmalara yönelik
    tüm genom analizlerinin
    yapılması ve bu tüm genomlara
    yönelik karşılaştırmalı
    çalışmaların gerçekleştirilmesi

    Elde edilen sonuçlar özelleştirilmiş veritabanları ve gelişmiş arama algoritmaları ile kullanılarak, genlere ait fonksiyonel bilgilere ulaşılması

    Örnek içerisinde ki türlerin belirlenmesi, bu türlerin genomlarının ne kadarlık bir bölümünün kapsandığının belirlenmesi

    Viral Metagenomik
    Dizileme ve Analiz

    Viral Metagenomik Dizileme ve Analiz Teknolojisi hakkında pdf kataloğumuzu indirebilirsiniz.
    PDF İndir
    EnglishTürkçe