Nucleus Genetics olarak genetik materyalde gizli olan şifreyi çözüp tanı, tedavi, gıda/su güvenliği vs. gibi konularda yeni ve güvenilir bir perspektif sunmayı ve toplumumuzda genetik gelişmelerle ilgili farkındalık yaratmayı amaçlamaktayız

Shotgun Metagenomik Dizileme ve Analiz

Shotgun metagenomik analizi ile bir örnek içerisinde bulunan tüm nükleik asit bilgisine ulaşmak mümkündür. Bu yöntem ile elde edilen toplam genomik materyalin tamamı dizilenir ve sonrasında hedef organizma gruplarına veya genlere yönelik veritabanları ile istenilen bilgilere ulaşılır. Günümüzde yaklaşık 290.000 mikrobiyal suş literatüre geçmiştir fakat uzun okumanın kısıtlamalarından dolayı bakteriyel genom datasının %90’ı eksiktir. Oxford Nanopore uzun okuma teknolojisi ile mikrobiyal genomun full karakterizasyonu sayesinde mikrobiyal evrim, antibiotik direnci ve daha bir çok konuya ilgili yeni kapılar açmaktadır.
Oxford Nanopore Teknolojisi ile Dizileme
Kütüphane Hazırlığı

Yazılım

Biyoinformatik hizmeti ya da
Oxford Nanopore Teknolojilerinin sağladığı biyoinformatik yazılımları

Örnek Türleri
  • İnsan
  • Hayvan
  • Çevre
  • Gıda
  • Endüstri

Gerçek Zamanlı Dizileme ve Analiz
  • MinION Mk1C GridION X5 

Dizileme Kimyası ve Özellikleri

Metagenomik Analizler

Massive Bioinformatics Oxford Nanopore teknolojisi ile üretilen uzun amplikonlar ile analizler sunmaktadır. Korunmuş bölgelere sahip olmayan virüs gibi organizmalara yönelik yapılacak metagenomik analizlerde shotgun dizileme yöntemleri öne çıkmaktadır. Ayrıca, yeni enzimlerin keşfi, antimikrobiyal direnç genlerinin saptanması, ortamda bulunan mikroorganizmaların tüm genomunun oluşturulması, zamana bağlı değişim analizleri gibi bir çok farklı amaca bu analizler ile ulaşmanız mümkündür.

OXFORD NANOPORE TEKNOLOJİLERİ İLE HİZMET ALIM KOŞULLARI

– Uzun okuma ile tüm genom dizilemelerinde insersiyon ve delesyonları analiz edebilirsiniz.
– Organizmaların tür tayininde kesin sonuca kayıtsız bir şekilde ulaşabilirsiniz.

  • Hizmet Alımı Öncesi
  • Hizmet Alımı Sonrası
  • Önerilen DNA ekstraksiyon kit ya da metodu nedir?
  • Saf kültür mü? Karışık kültür mü?
  • Hangi organizma tipi?
  • Tüm genom uzunluğu nedir?
  • Jel görüntüsü nasıl?
  • Yürütme bilgisi ve data (.Fast5 ya da .FastQ)
  • Biyoinformatik analizler*
  • De novo dizileme
  • Referans genom hizalama
  • Karşılaştırmalı genom analizleri
    İleri analizler
    * Biyoinformatik analiz hizmeti detayı için lütfen irtibata geçiniz
EnglishTürkçe