Nucleus Genetics olarak genetik materyalde gizli olan şifreyi çözüp tanı, tedavi, gıda/su güvenliği vs. gibi konularda yeni ve güvenilir bir perspektif sunmayı ve toplumumuzda genetik gelişmelerle ilgili farkındalık yaratmayı amaçlamaktayız

Covid 19

Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-coV-2) Aralık 2019 tarihinden itibaren dünya genelinde yaklaşık milyonlarca kişide tespit edilmiş ve milyonlarca bin kişinin ölümüne sebep olmuştur. Virüsün tüm genom sekansı hastalığın takibi ve tedavi çalışmalarında büyük önem taşımaktadır. Oxford Nanopore uzun okuma teknolojisi ile covid19 Örnek türleri virüsünün genomu tek seferde sekanslanabilmektedir, bu da virüsün taksonomik takibi ve özellikle tek gen mutasyonlarının tespitinde büyük avantaj sağlamaktadır.

Covid 19

PCR (Polymerase Chain Reaction), DNA içerisinde yer alan, dizisi bilinen iki segment arasındaki özgün bir bölgeyi enzimatik olarak çoğaltmak için uygulanan tepkimelere verilen ortak bir isim olarak tanımlanmaktadır. PCR bir tanı testi olarak bilinmektedir ve koronavirüste de virüse ait RNA'yı göstermektedir. Yani PCR test koronavirüs sürecinde, vücuttaki virüsün kimliğini göstermek için yapılan bir testtir. Farklı hastalıklar için de kullanılan PCR, vücuttaki çok az sayıdaki mikrobu bile tespit edebilmektedir. PCR testine moleküler tanı testi de denebilmektedir. Test, vücutta virüsün varlığını, ayrıca vücudun enfeksiyona yanıt olarak ürettiği antikorları belirleyebilmektedir.
Oxford Nanopore Teknolojisi ile Dizileme

Kütüphane Hazırlığı

Örnek Türleri
  • Kan
  • Salya
Gerçek Zamanlı Dizileme ve Analiz
  • MinION Mk1C GridION X5 

Dizileme Kimyası ve Özellikleri

*Deney süresi örnek sayısına göre değişiklik göstermektedir.

Biyoinformatik Analizler

OXFORD NANOPORE TEKNOLOJİLERİ İLE HİZMET ALIM KOŞULLARI
  • Covid-19 Amplikon Dizileme için Numune Kriterleri
  • Covid19 Shotgun Dizileme İçin Numune Kriteri
  • cDNA kabul edilmektedir.
    (Oxford Nanopore için optimize edilmiş ters transkripsiyon kiti
    verilecektir)
  • cDNA -20°C saklama koşulu ile gönderilmelidir.
  • Ct değeri 27 ve altı olmalıdır.
  • Jel konfirmasyonu gerekmektedir.
  • cDNA kabul edilmektedir.
  • cDNA konsantrasyonu 1000 ng ve üstü, en az 15 µl hacimde
    olmalıdır.
  • Ct değeri 20 ve altı olmalıdır.
  • 260/280 değeri 1.7-1.9 arasında olamlıdır.
  • Jel konfirmasyonu gerekmektedir.
EnglishTürkçe